- Кодонний склад
- Амінокислотний склад
- Загальний нуклеотидний склад
- Генний нуклеотидний склад
- Кодонні індекси
- Залежність нуклеотидів від індекса
- Скачати статистику
- Скачати гени
Всі нуклеотиди у гені
Нуклеотиди у перші позиції
Нуклеотиди у другій позиції
Нуклеотиди у третій позиції
Частота вживання кодонів, обчислина на основі усього генома
Частота вживання кодонів, обчислина на основі рибосомальних генів
Частота вживання кодонів, обчислина на основі генів у яких присутні всі кодони
Всі варіанти розрахунку CAI
CAI_A und Nukleotide in den Genen
CAI_A нуклеотиди у перші позиції
CAI_A нуклеотиди у другій позиції
CAI_A нуклеотиди у третій позиції
Кодон | Любе значення | Присутній | Відсутній | Присутній в кількості [0;100]% |
---|---|---|---|---|
AAA | ; | |||
AAT | ; | |||
AAG | ; | |||
AAC | ; | |||
ATA | ; | |||
ATT | ; | |||
ATG | ; | |||
ATC | ; | |||
AGA | ; | |||
AGT | ; | |||
AGG | ; | |||
AGC | ; | |||
ACA | ; | |||
ACT | ; | |||
ACG | ; | |||
ACC | ; | |||
TAA | ; | |||
TAT | ; | |||
TAG | ; | |||
TAC | ; | |||
TTA | ; | |||
TTT | ; | |||
TTG | ; | |||
TTC | ; | |||
TGA | ; | |||
TGT | ; | |||
TGG | ; | |||
TGC | ; | |||
TCA | ; | |||
TCT | ; | |||
TCG | ; | |||
TCC | ; | |||
GAA | ; | |||
GAT | ; | |||
GAG | ; | |||
GAC | ; | |||
GTA | ; | |||
GTT | ; | |||
GTG | ; | |||
GTC | ; | |||
GGA | ; | |||
GGT | ; | |||
GGG | ; | |||
GGC | ; | |||
GCA | ; | |||
GCT | ; | |||
GCG | ; | |||
GCC | ; | |||
CAA | ; | |||
CAT | ; | |||
CAG | ; | |||
CAC | ; | |||
CTA | ; | |||
CTT | ; | |||
CTG | ; | |||
CTC | ; | |||
CGA | ; | |||
CGT | ; | |||
CGG | ; | |||
CGC | ; | |||
CCA | ; | |||
CCT | ; | |||
CCG | ; | |||
CCC | ; |
Aмінокислота | Любе значення | Присутній | Відсутній | Присутній в кількості [0;100]% |
---|---|---|---|---|
Ala | ; | |||
Arg | ; | |||
Asn | ; | |||
Asp | ; | |||
Cys | ; | |||
Gln | ; | |||
Glu | ; | |||
Gly | ; | |||
His | ; | |||
Ile | ; | |||
Leu | ; | |||
Lys | ; | |||
Met | ; | |||
Phe | ; | |||
Pro | ; | |||
Ser | ; | |||
Thr | ; | |||
Trp | ; | |||
Tyr | ; | |||
Val | ; |
Нуклеотид | Любе значення | Присутній | Відсутній | Присутній в кількості [0;100]% |
---|---|---|---|---|
A | ; | |||
T | ; | |||
G | ; | |||
C | ; | |||
A_1 | ; | |||
T_1 | ; | |||
G_1 | ; | |||
C_1 | ; | |||
A_2 | ; | |||
T_2 | ; | |||
G_2 | ; | |||
C_2 | ; | |||
A_3 | ; | |||
T_3 | ; | |||
G_3 | ; | |||
C_3 | ; |
Індекс | Любе значення | Присутній в кількості [0;1] |
---|---|---|
CAI_A | ; | |
CAI_R | ; | |
CAI_T | ; |
Розміру гена(нуклеотидах) [n;m] |
---|
; |