- Magazyn kodów
- Skład aminokwasowy
- Całkowity skład nukleotydów
- Skład nukleotydów genowych
- Indeksy kodonów
- Uzależnienie nukleotydów od indeksu
- Pobierz statystyki
- Pobierz geny
Wszystkie kwasy nukleinowe w genach
Nukleotydy w pierwszej pozycji
Nukleotydy w drugiej pozycji
Nukleotydy na trzeciej pozycji
Częstotliwość korzystania z kodonów opiera się na całym genomie
Częstotliwość wykorzystania kodonów opiera się na genach rybosomalnych
Współczynnik wykorzystania kodonów oblicza się na podstawie genów, w których obecne są wszystkie kodony
Wszystkie warianty obliczeń CAI
CAI_A i nukleotydy w genach
CAI_A nukleotydy w pierwszej pozycji
CAI_A nukleotydy w drugiej pozycji
CAI_A nukleotydy w trzeciej pozycji
Codon | Cokolwiek wartościowego | Present | Brakujące | Obecność w kwocie [0; 100]% |
---|---|---|---|---|
AAA | ; | |||
AAT | ; | |||
AAG | ; | |||
AAC | ; | |||
ATA | ; | |||
ATT | ; | |||
ATG | ; | |||
ATC | ; | |||
AGA | ; | |||
AGT | ; | |||
AGG | ; | |||
AGC | ; | |||
ACA | ; | |||
ACT | ; | |||
ACG | ; | |||
ACC | ; | |||
TAA | ; | |||
TAT | ; | |||
TAG | ; | |||
TAC | ; | |||
TTA | ; | |||
TTT | ; | |||
TTG | ; | |||
TTC | ; | |||
TGA | ; | |||
TGT | ; | |||
TGG | ; | |||
TGC | ; | |||
TCA | ; | |||
TCT | ; | |||
TCG | ; | |||
TCC | ; | |||
GAA | ; | |||
GAT | ; | |||
GAG | ; | |||
GAC | ; | |||
GTA | ; | |||
GTT | ; | |||
GTG | ; | |||
GTC | ; | |||
GGA | ; | |||
GGT | ; | |||
GGG | ; | |||
GGC | ; | |||
GCA | ; | |||
GCT | ; | |||
GCG | ; | |||
GCC | ; | |||
CAA | ; | |||
CAT | ; | |||
CAG | ; | |||
CAC | ; | |||
CTA | ; | |||
CTT | ; | |||
CTG | ; | |||
CTC | ; | |||
CGA | ; | |||
CGT | ; | |||
CGG | ; | |||
CGC | ; | |||
CCA | ; | |||
CCT | ; | |||
CCG | ; | |||
CCC | ; |
Aminokwas | Cokolwiek wartościowego | Present | Brakujące | Obecność w kwocie [0; 100]% |
---|---|---|---|---|
Ala | ; | |||
Arg | ; | |||
Asn | ; | |||
Asp | ; | |||
Cys | ; | |||
Gln | ; | |||
Glu | ; | |||
Gly | ; | |||
His | ; | |||
Ile | ; | |||
Leu | ; | |||
Lys | ; | |||
Met | ; | |||
Phe | ; | |||
Pro | ; | |||
Ser | ; | |||
Thr | ; | |||
Trp | ; | |||
Tyr | ; | |||
Val | ; |
Nukleotyd | Cokolwiek wartościowego | Present | Brakujące | Obecność w kwocie [0; 100]% |
---|---|---|---|---|
A | ; | |||
T | ; | |||
G | ; | |||
C | ; | |||
A_1 | ; | |||
T_1 | ; | |||
G_1 | ; | |||
C_1 | ; | |||
A_2 | ; | |||
T_2 | ; | |||
G_2 | ; | |||
C_2 | ; | |||
A_3 | ; | |||
T_3 | ; | |||
G_3 | ; | |||
C_3 | ; |
Indeks | Cokolwiek wartościowego | Obecny w liczbie [0; 1] |
---|---|---|
CAI_A | ; | |
CAI_R | ; | |
CAI_T | ; |
Wielkość genu (nukleotydy) [n; m] |
---|
; |